Naruto Shippuden
La acción empieza tras los dos años y medio que el protagonista, Naruto Uzumaki, ha pasado entrenando con su maestro Jiraiya. En ella reaparecen todos los personajes de la anterior serie pero con más experiencia y fuerza. Además, la Organización Akatsuki entra definitivamente en acción, tras su breve aparición en la parte anterior, y se revelan sus objetivos. El enemigo principal de la parte anterior de Naruto, Orochimaru, ha estado mientras tanto entrenando a Sasuke Uchiha, antiguo compañero de Naruto, que abandonó voluntariamente la aldea para ganar fuerza gracias a este personaje, y así poder tomar venganza contra su hermano, Itachi Uchiha.
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La reunión de los 5 Kages · Episodio 221: Almacenamiento
Naruto pone la mano en el sello, antes de eso recuerda las veces que perdió el control, ahora desea entrenar para controlar al Kyūbi. Mientras en otro lado aparecen cadáveres que son encontrados por Anko, lo cual toda las pistas va a Kabuto, lo cual este se reúne con Madara siendo rechazado por ser traidor de Akatsuki, los dos negocian para aliarse en la guerra, Madara lo rechaza, pero Kabuto usa Edo Tensei lo cual tiene cinco cuerpos de Akatsuki muertos y otro féretro sin revelarse, lo cual Kabuto desea a Sasuke a cambio de ese cuerpo, lo cual Madara piensa y acepta el trato.
