Naruto Shippuden
La acción empieza tras los dos años y medio que el protagonista, Naruto Uzumaki, ha pasado entrenando con su maestro Jiraiya. En ella reaparecen todos los personajes de la anterior serie pero con más experiencia y fuerza. Además, la Organización Akatsuki entra definitivamente en acción, tras su breve aparición en la parte anterior, y se revelan sus objetivos. El enemigo principal de la parte anterior de Naruto, Orochimaru, ha estado mientras tanto entrenando a Sasuke Uchiha, antiguo compañero de Naruto, que abandonó voluntariamente la aldea para ganar fuerza gracias a este personaje, y así poder tomar venganza contra su hermano, Itachi Uchiha.
Naruto Shippuden
El confinamiento de los Jinchurikis · Episodio 257: Décimo Aniversario: Reunión*
**Episodio de Relleno** Un joven Naruto pinta las casas de los aldeanos y se va corriendo, mientras que escucha a todos quejarse de que no hay nadie para pagar sus daños y perjuicios porque Naruto no tiene padres. Más tarde, cuando el Tercer Hokage llega a su casa para darle su dinero, Naruto le pregunta quiénes fueron sus padres, el Hokage se niega a contestar, le dice a Naruto que no traería de vuelta a los muertos. Unos años más tarde, mientras que en la Academia, Naruto se encuentra Sasuke Uchiha y es continuamente derrotado por él. Durante una pelea, Naruto se da cuenta de que los ojos de Sasuke están llenos de odio. Poco después, se entera de que Sasuke es el único superviviente de la masacre del Clan Uchiha. Después de graduarse, Naruto y Sasuke se colocan en el mismo equipo junto a Sakura Haruno y logran pasar la prueba de Kakashi.
